Опираясь на  примеры наследования признаков при моно - и дигибридном скрещивании иногда складывается впечатление, что генотип организма сложен из суммы отдельных, независимо действующих генов, определяющих развитие конкретно своего признака или свойства. Такая связь гена с признаком чаще всего не может соответствовать действительности.На самом деле есть множество признаков и свойств живых организмов, определяющиеся при помощи  двух и более пар генов, и наоборот, многие признаки контролируются одним геном. Помимо этого, действие гена может меняться под воздействием  соседних других генов и условий окружающей среды. Исходя из этого, в онтогенезе принимают участие не отдельные гены, а весь генотип как единая система, имеющая сложные связи и взаимодействия между ее компонентами. Эта система является  динамичной, так как появившиеся в результате мутаций новые аллелеи или гены, сформированные новые хромосомы и даже новые геномы приводят к изменению генотипа во времени.
Ген в составе генотипа как системы может проявлять себя по-разному, изменяться в зависимости от ситуации и различных факторов. В этом убеждаешься, рассмотрев свойства генов, и то, как они проявляют себя в признаках.
Действия гена дискретны, а именно, обособлены в своей активности от других генов.
В своих проявлениях ген является достаточно специфичным, так как несет ответственность за конкретный  признак или свойство организма.
Действия гена могут быть градуальными. Он  усиливает степень проявления признака во время увеличения числа доминантных аллелей.
Один ген способен действовать на ход развития разных признаков - это является множественным, или плейотропным, действием гена.
Разные гены способны одинаково действовать на процесс развития одного и того же признака. Их называют множественными генами, или полигенами.
Ген иногда взаимодействует с другими генами, в результате чего, появляются новые признаки.
Действие гена модифицируется в зависимости от его местоположения в хромосоме или от воздействия всевозможных факторов внешней среды.